Os estudos ambientais realizados nos corpos hídricos são de grande relevância, tendo em vista a variedade de usos que são aplicados a estes. Para facilitar a interpretação dos parâmetros avaliados nas amostragens foram desenvolvidos diversos índices que podem responder a questões específicas para cada tipo de uso. O Índice de Qualidade da Água (IQA) identifica poluição proveniente de esgoto doméstico e o Índice de Qualidade da Água para Proteção da Vida Aquática (IQAPVA) responde a questões relacionadas às condições ambientais para manutenção da vida aquática, se utilizando apenas de dois parâmetros, afim de que haja uma redução do efeito eclipse. A região do baixo curso do rio São João apresenta diversos usos, entre eles o cultivo de ostras, e, como a grande maioria dos corpos hídricos brasileiros, possui diversos focos de poluição pontual. Foram aplicados nesta região os dois índices citados, tendo sido obtida uma categorização “boa” quanto ao IQA, na maioria dos pontos analisados, apenas diferindo destes resultados o ponto próximo ao canal dos Medeiros, o qual exibiu grande parte dos resultados incluídos na categorização “aceitável”. Porém com relação ao IQAPVA os resultados mostraram-se diferentes, com sua categorização sendo considerada “regular” na maioria das amostragens. Desta forma conclui-se que o efeito da poluição por efluente doméstico ainda não se configura como causa de degradação expressiva na bacia hidrográfica em estudo, o que pode ser justificado pela vazão do rio e pelo período de coleta, que em sua maioria, ocorreu com elevados índices de pluviosidade. Apesar da boa categorização, não é recomendável o cultivo de ostras no local, visto que seu índice apresentou classificação abaixo do esperado, e os níveis de Escherichia coli não se enquadraram nos valores máximos estabelecidos pela CONAMA 357/2005 para água salobra de Classe I.

Palavras-chave: IQA. IQAPVA. Ostreicultura. Rio São João.