Esta diretoria atua no âmbito dos cursos técnicos de nível médio (integrado e concomitante) e subsequente, é responsável por assessorar a Diretoria Geral nas questões relativas à Política de Ensino e Aprendizagem; promover ações que garantam articulações entre o Ensino, a Pesquisa e a Extensão; acompanhar e avaliar os cursos e propor ações e estratégias para a implantação, reformulação e desativação dos mesmos também assessorando o processo de (re)construção, reformulação e implementação do Projeto Pedagógico dos Cursos (PPC) observando o cumprimento das determinações contidas no Plano de Desenvolvimento Institucional e no Projeto Político Pedagógico Institucional.

1º Seminário de Ensino Médio Integrado Como e Por quê? - Professor Sidinei Cruz Sobrinho 

Ensino Integrado: dos Princípios (para que?) às Práticas Integradoras (como?) - Professor Ronaldo Marcos de Lima Araujo

O Ensino Médio Integrado no Contexto da Atual LDB - Professora Nilva Schroeder

Ensino Médio Integrado: a experiência do IFFarroupilha - RS - Professores Daiele Zuquetto Rosa Édison Gonzague Brito da Silva

Documento Base para a promoção da formação integral, fortalecimento do ensino médio integrado e implementação do currículo integrado no âmbito das Instituições da Rede EPCT conforme Lei 11.892/2008.