O Polo Embrapii do IFFluminense é uma Unidade composta por laboratórios onde são desenvolvidas ações de pesquisa, desenvolvimento e inovação na área de Tecnologias para Produção Mais Limpa, com foco em Eficiência Energética e Fontes Renováveis de Energia; Redução, Tratamento e Reaproveitamento de Resíduos e
Uso Racional de Recursos Hídricos.

 A unidade também é responsável pela formação de recursos humanos, programa de capacitação desenvolvido na sede do Centro de Referência do IFFluminense para profissionais das empresas parceiras, servidores e estudantes, responsáveis pela execução dos projetos. O programa visa a atender não só as demandas por capacitação técnica e de gestão atuais como a longo prazo, ampliando, dessa forma, as possibilidades do Polo de atender as solicitações das indústrias.